Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21818J3KMS6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm21818J3KMS6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm21818J3KMS6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21818J3KMS6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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