Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp408H7BX78 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms