Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm20517G3UVU6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20517G3UVU6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms