Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms