Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms