Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms