Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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