Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms