Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema6cQ9WTM3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema6cQ9WTM3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms