Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nek3Q9R0A5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek3Q9R0A5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms