Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gpc6Q9R087 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gpc6Q9R087 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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