Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Col5a3Q9JLI2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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