Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr5Q9JLF7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlr5Q9JLF7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms