Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pole3Q9JKP7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole3Q9JKP7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms