Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gfra4Q9JJT2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms