Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms