Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhox9Q9EQM5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms