Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms