Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clstn1Q9EPL2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms