Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Subh2bvQ9D9Z7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Subh2bvQ9D9Z7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Subh2bvQ9D9Z7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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