Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms