Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lhfpl3Q9CTN8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms