Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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