Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ssxb1Q9CPU1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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