Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pbx4Q99NE9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pbx4Q99NE9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pbx4Q99NE9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms