Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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