Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms