Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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