Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms