Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms