Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms