Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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