Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms