Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim68Q8K243 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim68Q8K243 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Trim68Q8K243 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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