Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Lrit1Q8K099 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrit1Q8K099 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms