Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

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Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cog3Q8CI04 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog3Q8CI04 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms