Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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