Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppfibp1Q8C8U0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms