Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp37Q8C0R0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp37Q8C0R0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms