Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr9Q8BV84 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms