Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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