Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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