Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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