Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Dsg1cQ7TSF0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms