Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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