Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubfd1Q78JW9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ubfd1Q78JW9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubfd1Q78JW9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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