Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tpm4Q6IRU2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tpm4Q6IRU2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm4Q6IRU2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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