Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Pdzrn3Q69ZS0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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