Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Top2bQ64511 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms