Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms